Test SPARKbiom potrafi precyzyjnie identyfikować ponad 50 tyś. różnych organizmów w próbce, w tym bakterie, grzyby i pasożyty. Ta kompleksowość jest nieosiągalna dla tradycyjnych testów, takich jak posiewy czy standardowe testy PCR, które są ograniczone do wykrywania znacznie mniejszej liczby patogenów. W porównaniu, standardowa metoda PCR (reakcja łańcuchowa polimerazy) jest ograniczona do wykrywania tylko tych organizmów, dla których specyficzne startery DNA zostały zaprojektowane i użyte w danym teście (waha się zazwyczaj od kilku do kilkudziesięciu). Tradycyjne metody diagnostyczne, zdolne do identyfikacji tylko ograniczonej liczby gatunków, okazują się nieadekwatne i pomijają znaczącą większość organizmów obecnych w mikrobiomie. Test SPARKBIOM umożliwia identyfikacje pełnego składu gatunkowego mikrobiomu.

Test SPARKbiom potrafi precyzyjnie identyfikować ponad 50 tyś. różnych organizmów w próbce, w tym bakterie, grzyby i pasożyty. Ta kompleksowość jest nieosiągalna dla tradycyjnych testów, takich jak posiewy czy standardowe testy PCR, które są ograniczone do wykrywania znacznie mniejszej liczby patogenów. W porównaniu, standardowa metoda PCR (reakcja łańcuchowa polimerazy) jest ograniczona do wykrywania tylko tych organizmów, dla których specyficzne startery DNA zostały zaprojektowane i użyte w danym teście (waha się zazwyczaj od kilku do kilkudziesięciu). Tradycyjne metody diagnostyczne, zdolne do identyfikacji tylko ograniczonej liczby gatunków, okazują się nieadekwatne i pomijają znaczącą większość organizmów obecnych w mikrobiomie. Test SPARKBIOM umożliwia identyfikacje pełnego składu gatunkowego mikrobiomu.

Skuteczna analiza mikrobiomu wymaga rozpoznawania organizmów na poziomie gatunku. Bez tego nie można odróżnić, czy organizm w mikrobiomie jest patogenem (chorobotwórczym), czy probiotykiem (leczącym). Standardowym przykładem jest brak możliwości rozróżnienia Streptococcus thermophilus (probiotyk) od Streptococcus pyogenes (patogen).

Kluczowe dla identyfikacji gatunkowej są długie fragmenty sekwencji, największa baza danych sekwencji oraz najdokładniejszy algorytm identyfikacji, jakim jest referencyjny BLAST. Nasz test SPARKbiom spełnia te wymagania, korzystając ze wszystkich sekwencji dostępnych na początku 2024 roku, czyli ponad 1 miliona, oraz zaawansowanych algorytmów równoważnych z BLAST, co zapewnia precyzyjną identyfikację.

Sekwencjonowanie II generacji używa krótkich sekwencji, co uniemożliwia rozróżnienie organizmów na poziomie gatunku. Komercyjnie dostępne technologie III generacji, mimo że korzystają z long reads, najczęściej mają ograniczoną bazę danych do około 30 tysięcy sekwencji i opierają się na mniej dokładnych algorytmach, takich jak Centrifuge.

Firma SPARK-TECH powstała w 2015 roku w Krakowie, aby wspierać rozwój sektora zdrowotnego za pomocą innowacyjnych rozwiązań z zakresu biotechnologii, bioinformatyki, robotyki i sztucznej inteligencji.
Spółka uzyskała liczne nagrody i granty z agencji Unii Europejskiej (HORIZON 2020) oraz Polskich (NCBR, PARP). W ramach prowadzonych prac badawczo rozwojowych, powstał prototyp robota do izolacji komórek krwi oraz została opracowana autorska technologia sekwencjonowania mikrobiomu.
W 2021 roku decyzją Minister Klimatu i Środowiska laboratorium biotechnologiczne SPARK-TECH uzyskało status zakładu inżynierii genetycznej, z możliwością zamkniętego użycia mikroorganizmów genetycznie zmodyfikowanych zaliczonych do II kategorii zagrożenia.
W 2022 roku firma wprowadziła na rynek usługę sekwencjonowania DNA dla: uczelni wyższych, firm produkujących probiotyki oraz do diagnostyki zwierząt hodowlanych.
W 2023 laboratorium SPARK-TECH Diagnostyka zostało wpisane przez Wojewodę Małopolski do Rejestru Podmiotów Wykonujących Działalność Leczniczą, aby świadczyć usługi sekwencjonowania DNA dla Pacjentów. Stanowi to ważny krok naprzód w dziedzinie medycyny personalizowanej i strategii leczenia.